茎环引物在效率和特异性方

面优于传统引物。检测对成熟具有特异性可区分仅相差一个核苷酸的相关。此外它们不受基因组污染的影响。对于大多数通常只需的总即可实现精确定量。事实上该方法的高灵敏度特异性和精确度使得无需核酸纯化即可直接分析单个细胞。与标准基因表达测定一样测定显示出七个数量级的动态范围。对种小鼠组织中种的定量显示每个细胞的变异程度从不到个拷贝到超过个拷贝。

该方法能够快速准确和灵敏地进行表达谱分

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它们被认为对于细胞发育分化和通讯至关重要。具体作用包括调节细胞增殖和代谢发育时机细胞死亡造血神经元发育人类肿瘤发生以及甲基化和染色质修饰。尽管代表了一类相对丰富的转录物但它们的表达水平在物种和组织之间差异很大。丰度较低的通常会逃避克隆杂交和微阵列分析等技术